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Nat Methods:利用TruSPADES方法显著改善宏基因组测序

发布日期:2016-03-10    作者:昭远制药    

2016年2月24日 讯 /生物谷BIOON/ - - 近来几篇文章发现与癌症相关的一些特异基因表达由一些表观遗传调控因子所介导。Smyd3(Smad3)是一种胞质赖氨酸甲基转移酶,在肝癌和结直肠癌患者表达量明显升高。去年一篇Nature文章指出在小鼠Ras诱导肿瘤生成的模型中,Smyd3的表达及功能对肿瘤发生是必需的,并提到可将Smyd3作为一个潜在的癌症治疗靶点。

最近一篇发表在Cancer Cell的文章指出Smyd3表达和功能对肝癌和结直肠癌发展提供帮助。他们研究发现Smyd3在肝癌患者体内高表达,并对肝癌患者的确诊具有高度的辨识能力,同时对肝癌患者临床预后差成正相关。他们在小鼠化学诱导肝癌和结直肠癌模型实验中发现Smyd3的功能对肝癌和结直肠癌中细胞增殖起着决定作用,而且Smyd3缺失对肝癌和结直肠癌的发展都起着抑制的作用。这部分实验结果证明Smyd3表达和功能是肝癌和结直肠癌进展所必需的。另外,他们还发现Smyd3能直接与三甲基化组蛋白H3K4尾巴相互作用,从而被招募到活性基因调控区影响基因的活化。在多数调控区,它们的功能是中性的。但在一组特定促进癌基因的转录调控区,Smyd3起着转录增强的作用。研究者实验表明Smyd3在细胞核内对众多促癌基因的转录起着正向调控作用。而且Smyd3能促进细胞内一部分原癌基因的活化以及细胞EMT转化。在正常条件下对Smyd3失活不会出现任何异常,Smyd3抑制剂的生物毒性非常小,总的来讲这些实验结果表明对Smyd3的功能抑制剂可以成为癌症治疗的候选药物。

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